Technical Reports Published in 2022

  • IC-22-05 pdf bib
    Análise transcriptômica de dados de osteossarcoma com os softwares HISAT2 e StringTie.
    Julia Pietro and Jo ao Meidanis.
    April 2022. In Portuguese, 12 pages.

    Resumo: Análises transcriptômicas têm se mostrado necessárias no ramo da Medicina, pois faz-se viável a identificação de produtos da transcrição do DNA em diferentes moléculas. No caso de mutações, como em células cancerígenas, os transcritos e proteínas sofrem alterações, o que torna possível analisar o padrão de expressão, com base nos produtos e vias ativas. A partir disso, tratamentos podem ser desenvolvidos, visando a sobrevivência e o bem-estar de pacientes. Desse modo, com base nos dados de 35 pacientes do Centro Infantil Boldrini e com auxílio do CENAPAD, sequências de RNA de crianças com osteossarcoma foram analisadas via softwares e linguagens de programação. Este projeto teve como principal objetivo a obtenção de dois produtos finais: matrizes com contadores de genes e transcritos por amostras, que irão alimentar estudos sobre vias metabólicas e expressão diferencial de genes. Para isso, as amostras passaram por testes de qualidade, limpeza de sequências, mapeamento com genoma de referência e, finalmente, o processo de contagem de transcritos. Os relatórios antes da limpeza expressaram resultados com baixas estatísticas básicas. Estes percentuais serviram de auxílio para realizar os ajustes necessários nas amostras, como retirar bases de baixa qualidade. Desse modo, logo após a limpeza dos dados, o relatório de qualidade apresentou melhoras significativas na qualidade das sequências. Então, o mapeamento das leituras com o genoma de referência resultou em taxa de alinhamento com média de 95,91%. Por último, a contagem de transcritos forneceu tabelas com os níveis de transcritos e genes expressos por amostras. Dessa forma, durante o PEOp 2022 foi possível desenvolver técnicas de bioinformática e chegar ao resultado esperado.

  • IC-22-04 pdf bib
    Aquarela virtual: Investigando imaginação em uma experiência socioenativa.
    Maria Jêsca Nobre de Queiroz, Josiane Rosa de Oliveira Gaia Pimenta, Emanuel Felipe Duarte, Yusseli Lizeth Méndez Mendoza, Julio Cesar dos Reis, and M. Cecília C. Baranauskas.
    March 2022. In Portuguese, 14 pages.

    Abstract: Este relatório técnico descreve as atividades de pesquisa que investiga a imaginação dentro do contexto de uso do sistema Aquarela Virtual. Este estudo foi conduzido durante o quinto ano do Projeto Temático Sistemas Socioenativos (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, #2015/16528-0). Neste relatório, apresentamos brevemente o contexto do Projeto Sistemas Socioenativos, descrevemos o conceito de imaginação; em seguida descrevemos o conceito do sistema Aquarela Virtual, motivado pelo isolamento social decorrente da pandemia de COVID-19. Em particular apresentamos resultados preliminares de um estudo de caso sobre o uso da imaginação na interação com o sistema Aquarela Virtual.

  • IC-22-03 pdf bib
    Aquarela virtual: Investigando acesso equitativo em instalação socioenativa em contexto de isolamento social.
    Josiane Rosa de Oliveira Gaia Pimenta, Emanuel Felipe Duarte, Maria Jêsca Nobre de Queiroz, Yusseli Lizeth Méndez Mendoza, José Valderlei da Silva, and M. Cecília C. Baranauskas.
    February 2022. In Portuguese, 16 pages.

    Resumo: Este relatório técnico descreve as ações de avaliação de acesso equitativo nas oficinas do Aquarela Virtual, sistema desenvolvido durante o quinto ano do Projeto Temático Sistemas Socioenativos (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, #2015/16528-0). Aquarela Virtual é uma iniciativa para estudar sistemas socioenativos no contexto remoto gerado pelo isolamento social da pandemia do COVID-19. Este relatório apresenta a oficina sobre a perspectiva do acesso, bem como descreve as atividades de avaliação da instalação realizadas e seus resultados preliminares.

  • IC-22-02 pdf bib
    Resultados preliminares de uma experiência sócio-afetiva enativa: Um estudo de caso com o sistema aquarela virtual.
    Luã Marcelo Muriana, Josiane Rosa de O. Gaia Pimenta, Maria Jêsca Nobre de Queiroz, Yusseli Lizeth Méndez Mendoza, and M. Cecília C. Baranauskas.
    February 2022. In Portuguese, 16 pages.

    Resumo: A cognição, na perspectiva da enação, é um processo vital, incorporado, criador e coletivo, de modo que ela atua como uma ação incorporada. Neste sentido, o processo de produção de sentido (sense-making) ocorre a partir da relação entre um sujeito e um mundo a partir do sistema de ação- percepção desse sujeito. Entretanto, as relações sociais e os fatores emocionais também têm papel atuante nesse processo de produção de sentido. Assim, o objetivo deste trabalho é analisar a experiência socioenativa durante a interação de crianças com o Sistema Aquarela Virtual destacando os aspectos sócio-afetivos emocionais desse processo e como eles afetam a produção de sentido dos usuários (individual e socialmente). Os resultados preliminares da análise destacam que mesmo um ambiente virtual com usuários distantes e com acesso remoto (sem a presença física), tem capacidade de influenciar a socio-afetividade emocional entre eles.

  • IC-22-01 pdf bib
    Aquarela virtual: Design e desenvolvimento de um sistema socioenativo em contexto de isolamento social.
    Emanuel Felipe Duarte, Yusseli Lizeth Méndez Mendoza, Maria Jêsca Nobre de Queiroz, Josiane Rosa de Oliveira Gaia Pimenta, José Valderlei da Silva, and M. Cecília C. Baranauskas.
    February 2022. In Portuguese, 20 pages.

    Resumo: Este relatório técnico apresenta o processo de design e desenvolvimento do sistema Aquarela Virtual, conduzido durante o quinto ano do Projeto Temático Sistemas Socioenativos (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, #2015/16528-0). Neste relatório, apresentamos brevemente o contexto do Projeto Temático Sistemas Socioenativos, e em seguida descrevemos o conceito do sistema Aquarela Virtual, motivado pelo isolamento social decorrente da pandemia de COVID-19. As principais funcionalidades do sistema são descritas e discutidas neste relatório, com o objetivo de documentar decisões de design e desenvolvimento. Por fim, finalizamos o relatório com conclusões sobre o processo e algumas possíveis direções para aprimoramentos do sistema no decorrer do próximo ano.


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