MO640 A	Biologia Computacional 1o. sem/2011 - Instrutor: João Meidanis
T/Q	Data	Atividade	Questões
Ter	22/02/2011	Apresentação
Qui	24/02/2011	Motivação
Ter	01/03/2011	Biologia Molecular - text: C-B2011; tag: bio. mol.	48
Qui	03/03/2011	Biologia Molecular - text: C-B2011; tag: bio. mol.	“
Ter	08/03/2011	Não haverá atividades
Qui	10/03/2011	Propriedade dos uns consecutivos - text: Benz1959; tag: gen. fine struct.	102
Ter	15/03/2011	Propriedade dos uns consecutivos - text: BL1976; tag: PQ	“
Qui	17/03/2011	Propriedade dos uns consecutivos - text: MPT1998; tag: PQR	“
Ter	22/03/2011	Propriedade dos uns consecutivos - text: TM2005; tag: almost linear	“
Qui	24/03/2011	Exercícios
Ter	29/03/2011	Revisão
Qui	31/03/2011	PROVA ESCRITA INDIVIDUAL
Ter	05/04/2011	Exercícios
Qui	07/04/2011	Exercícios
Ter	12/04/2011	Comparação de seqüências - text: SM97; tag: global, local, semi-local	56
Qui	14/04/2011	Comparação de seqüências - text: SM97; saving space, gap penalty functions, similar sequences,	“
Ter	19/04/2011	Comparação de seqüências - text: SM97; database search, similarity and distance	“
Qui	21/04/2011	Não haverá atividades
Ter	26/04/2011	Montagem de fragmentos de DNA - text: SM97, GJB+2006, Meid1999, SY2005; tag: sequencing technology, basic assembly, assembly evaluation	22
Qui	28/04/2011	Montagem de fragmentos de DNA - text: HM1999, PTW2001, CTP2004; tag: assembly tools	“
Ter	03/05/2011	Revisão
Qui	05/05/2011	PROVA ORAL EM GRUPO
Ter	10/05/2011	Tendências - text: Eddy2005, Meid2003, Pevz2004; tag: overview	23
Qui	12/05/2011	Evolução - text: EG2001, MBG2003, Quit2005 [cap.4], Embo2004; tag: evolution	27
Ter	17/05/2011	Evolução - text: EG2001, MBG2003, Quit2005 [cap.4], Embo2004; tag: evolution	“
Qui	19/05/2011	Árvores filogenéticas - text: Fels2004, SM97; tag: discrete characters	16
Ter	24/05/2011	Árvores filogenéticas - text: Fels2004, SM97, Quit2005 [cap.2]; tag: counting, topology, distance trees	“
Qui	26/05/2011	Haplótipos - text: GO2005; tag: haplotypes	3
Ter	31/05/2011	Revisão
Qui	02/06/2011	PROVA ESCRITA INDIVIDUAL
Ter	07/06/2011	Rearranjo de genomas - text: Meid2004; tag: operations	160
Qui	09/06/2011	Rearranjo de genomas - text: BP1998, DM2002a, DM2002b, FM2004, Fort2005, MD2001, MWD1997, MWD2002, SM97; tag: transpositions	“
Ter	14/06/2011	Rearranjo de genomas - text: Chri1996, BMS2006, YAF2005, tag: block interchange, translocations, DCJ	“
Qui	16/06/2011	Rearranjo de genomas - text: HP1999, SM97, Mnei2004, Berg2005, KST1997; tag: reversals	“
Ter	21/06/2011	Rearranjo de genomas - text: HP1999, SM97, Mnei2004, Berg2005, KST1997; tag: reversals	“
Qui	23/06/2011	Não haverá atividades
Ter	28/06/2011	Rearranjo de genomas - text: MD2000, MD2001, Alme2007; tag: algebra	“
Qui	30/06/2011	Revisão
Ter	05/07/2011	PROVA ORAL EM GRUPO
Qui	07/07/2011	Considerações finais