MO640 - Exercícios - Sobre a aula de 2006-03-27

  1. Duas seqüências de DNA de 41 caracteres diferem em 6 posições. Admitindo que sua evolução segue o modelo de Jukes-Cantor, qual é a distância de Jukes-Cantor entre elas?
  2. Duas seqüências de DNA de 100 caracteres diferem entre si em 6 transversões e 9 transições. Admitindo que sua evolução segue o modelo de dois parâmetros de Kimura, calcule as taxas de transições e transversões multiplicadas pelo tempo transcorrido. Como estes números são usados pelo software fdnadist para calcular a distância de Kimura entre as duas seqüências? É a mesma fórmula usada pelo software Mega http://evolgen.biol.metro-u.ac.jp/MEGA/manual/Distance.html?
  3. Calcule as distâncias de Jukes-Cantor e de Kimura entre as seqüências abaixo:

    CTAGGCTTACGATTACGAGGATCCAAATGGCACCAATGCT
    CTACGCTTACGACAACGAGGATCCGAATGGCACCATTGCT


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