MO640 - Exercícios - Para 2004-09-27

  1. Considere as seqüências abaixo:

    s = CAGCACTTGGATTCTCGG, t = CAGCGTGG

    e o sistema de pontuação que dá +1 para match, -1 para mismatch, e -2 para espaço.  Complete a tabela a seguir com as similaridades semi-globais entre s e t.

    Dica: monte a matriz de programação dinâmica numa planilha de cálculo. Desta forma, com pequenas modificações nela você pode obter todos os valores acima.

    Buracos em:
    Similaridade semi-global
    Início de s
    Final de s
    Início de t
    Final de t
    Cobra
    Cobra
    Cobra
    Cobra

    Cobra Cobra Cobra Não cobra
    Cobra Cobra Não cobra Cobra
    Cobra Cobra Não cobra Não cobra
    Cobra Não cobra Cobra Cobra
    Cobra Não cobra Cobra Não cobra
    Cobra Não cobra Não cobra Cobra
    Cobra Não cobra Não cobra Não cobra
    Não cobra
    Cobra Cobra Cobra
    Não cobra Cobra Cobra Não cobra
    Não cobra Cobra Não cobra Cobra
    Não cobra Cobra Não cobra Não cobra
    Não cobra Não cobra Cobra Cobra
    Não cobra Não cobra Cobra Não cobra
    Não cobra Não cobra Não cobra Cobra
    Não cobra Não cobra Não cobra Não cobra


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