O Instituto de Computação possui nove laboratórios de pesquisa, todos eles instalados no prédio IC-2 localizado na Av. Albert Einstein, 1251:

• Laboratório de Administração e Segurança de Sistemas (LAS)
• Laboratório de Criptografia Aplicada (LCA)
• Laboratório de Sistemas de Informação (LIS)
• Laboratório de Informática Visual (LIV)
• Laboratório de Otimização e Combinatória (LOCo)
• Laboratório de Redes de Computadores (LRC)
• Laboratório de Sistemas de Computação (LSC)
• Laboratório de Sistemas Distribuídos (LSD)
• Laboratório para Inferência em Dados Complexos (RECOD)

Docentes e alunos do Instituto de Computação também desenvolvem as suas atividades de pesquisa no:

• Núcleo de Informática Aplicada à Educação (NIED)